Subiect: #biologie computațională
NVIDIA dezvăluie BioNeMo Inference Runtime: cum a reușit să tripleze viteza de pliere a proteinelor pe GPU-uri H100
NVIDIA a publicat detalii despre BioNeMo Inference Runtime (BioIR), o bibliotecă Python care accelerează modelele de predicție a structurii proteinelor pe GPU-uri H100. Într-un benchmark pe 1.000 de ținte umane, versiunea Boltz-2 accelerată cu BioIR a atins 58.500 de resturi pliate per GPU-oră, de 2,90 ori mai mult decât o implementare open-source compilată cu torch. Runtime-ul optimizează la trei niveluri — kernel-uri personalizate, captură CUDA Graph și replicare distribuită prin Ray — și a alimentat deja extinderea bazei de date AlphaFold, cu aproximativ 31 de milioane de complexe proteice candidate.
Anthropic lansează Claude Science: un asistent AI pentru cercetarea științifică, similar cu Claude Code pentru inginerie software
Anthropic lansează Claude Science, un asistent AI autonom pentru cercetarea științifică, similar cu Claude Code pentru inginerie software. Produsul este specializat în biologie computațională și dezvoltare de medicamente, fiind deja disponibil pentru abonați. Anthropic îl va folosi și pentru propriile cercetări asupra bolilor rare.
Cercetătorii spun că administrația Trump găsește noi modalități de a pedepsi știința
Administrația Trump a întrerupt finanțarea pentru mii de cercetători, inclusiv pentru profesorul Sean Eddy de la Harvard, al cărui laborator a fost devastat. Deși fondurile au fost parțial restaurate, birocrația și teama persistă, iar știința americană suferă pierderi ireparabile.
Arc Virtual Cell Challenge: O inițiere în modelarea celulară virtuală
Arc Virtual Cell Challenge propune o revoluție în biologia computațională: antrenarea unui model AI capabil să simuleze efectele perturbărilor genetice fără a necesita experimente fizice costisitoare. Articolul explorează arhitectura modelului STATE, utilizarea modelelor de limbaj proteic și metricile complexe de evaluare.